UNAIC berawal dari Akademi Keperawatan (AKPER) Al-Irsyad Al-Islamiyyah Cilacap yang berdiri pada tahun 1995. Seiring perkembangan, AKPER kemudian bertransformasi menjadi STIKES Al-Irsyad Al-Islamiyyah Cilacap pada tahun 2003. Dengan berbagai pencapaian dan kepercayaan dari Pemerintah Republik Indonesia , maka pada tahun 2021 STIKES resmi berubah bentuk menjadi Universitas Al-Irsyad Cilacap (UNAIC).
UNAIC kini memiliki tiga fakultas yang terdiri dari 13 program studi yang siap mencetak lulusan profesional:
Fakultas Ilmu Kesehatan
Fakultas Farmasi, Sains, dan Teknologi
Fakultas Ekonomi dan Bisnis